Tokom Drugog svetskog rata najviše Bošnjaka je bilo ubijeno u Višegradu, njih oko 5.000. U oktobru 1943. četnici su na Drinskoj ćupriji zaklali oko 1.500 Bošnjaka.
U opštini Višegrad 1991. živelo je ukupno 21.000 ljudi, dok je sam grad imao 9.000 stanovnika. Većina stanovnika su bili Bošnjaci – 63%, dok je Srba bilo 33%.
Dana 14. aprila 1992. Višegrad su okupirali: Užički korpus JNA, Užička teritorijalna odbrana, Beli orlovi i rezervisti.
Između 18. i 25. maja, Užički korpus je napustio grad, ostavljajući ga u ruke Belih orlova, šešeljevaca i četničkih bandi.
JNA se zvanično povlači iz Višegrada 19. maja 1992. godine.
Najozloglašenija srpska jedinica je bila ona koju je vodio Milan Lukić.
Jedno od najpoznatijih mučilišta Bošnjaka u Višegradu bio je motel Vilina vlas, gde su Bošnjaci, mučeni, ubijani, a žene i devojčice masovno i sistematski silovane.
Zločini:
• 19. jun - na Novom mostu ubijeno je i bačeno u Drinu 147 Bošnjaka.
• 14. jun - u jednom muslimanskoj kući u Pionirskoj ulici, specijalna jedinica pod komandom Milana Lukića, zatvorila je više od 60 muslimanskih civila koji su bežali iz Koritnika i Sasa i kuću zapalili. One koji su pokušali da pobegnu kroz jedan prozor ubijali su puškama. Svi osim šest osoba su živi izgoreli.
• 27. jun - na Bikavcu u kući Mehe Alića, zatvorili su 72 civila, najviše žene, decu i stare i zapalili ih. Preživela je Zehra Turjačanin, jedna od svedokinja pred Haškim tribunalom, u procesu protiv Milana Lukića, Sredoja Lukića i Mitra Vasiljevića.
62% od ukupnog broja nestalih nestalo je u junu i julu 1992. godine i svi su bili civili.
U Višegradu su srušene i zapaljene sve džamije.
U Višegradu i okolini ubijeno je oko 3.000 Bošnjaka.
Suđenja pred sudom Bosne i Hercegovine:
Boban Šimšić osuđen 2006. na 14 godina zatvora.
Nenad Tanasković osuđen 2007. na 12 godina zatvora.
Željko Lelek osuđen 2008. na 13 godina zatvora.
Miloš za Žuc